随着精准医疗时代的到来，分子生物学技术日新月异，为疾病的诊断和治疗提供了前所未有的精准手段。其中，Panel检测作为高通量测序技术的一种重要应用，正逐渐在多种疾病的临床应用中崭露头角。
下面，一起来了解一下Panel检测的基本原理、以及它在骨髓增殖性肿瘤（MPN）中的应用吧~
Panel检测，又称靶向基因测序，是一种基于高通量测序技术的定制化基因检测方法。该方法通过设计一组针对特定疾病或研究目标的基因引物，对选定基因组的特定区域进行深度测序，以实现对目标基因的精准筛查。与传统的测序方法如一代测序相比，Panel检测具有诸多优势[1]：
●周期短：Panel检测的检测时间只需要2-3周。
●通量高：由于仅关注特定基因或区域，所需成本大大减少，它能够一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定。
●目标基因覆盖全面：通过精准设计，能够全面覆盖MPN致病基因和突变位点。
●成本相对较低：Panel检测的样品为全血或者骨髓，通过试剂盒提取高质量DNA即可进行测序工作。
图源：摄图网
MPN是一类以骨髓细胞异常增殖为特征的血液系统恶性肿瘤。它的发病机制复杂，涉及多个基因的突变。检测基因突变是诊断MPN的重要步骤，对于MPN患者来说具有极其重要的意义。因此，如何高效、准确地进行基因突变检测，便成为了科学研究和临床应用中不可或缺且亟待深入探讨的课题。
传统的检测方法往往难以全面覆盖所有相关基因。它们通常只能针对特定的、已知的突变进行检测。相比之下，Panel检测具有显著的优势，它可以同时检测多个基因上的多个位点，从而更全面地覆盖与MPN相关的基因突变。
有研究团队利用由50个靶基因组成的测序Panel，对53例MPN患者的骨髓或血液标本进行了二代测序。不仅验证了经典的JAK2、CALR、MPL突变，还发现了其他多种致病性基因突变及与MPN个体易感性相关的SNP位点[2]。因此，Panel检测在MPN的分子诊断中具有重要的应用价值。
●JAK2突变在MPN患者中高发，此次研究中PV患者中达100%，彰显了此突变的核心致病作用。
●CALR突变则常见于ET和PMF患者，lCALR突变与JAK2/MPL阴性的MPN患者密切相关，为MPN的诊断提供了新的分子标志物。
●MPL突变虽相对少见，但此次研究中，在部分ET患者中检出，表明其一定相关性。
Panel检测还发现了其他11种致病性基因突变，包括TET2、EZH2、ASXL1等。这些基因的突变频率虽然低于经典突变，但在MPN的发病中同样发挥着重要作用。其中，TET2突变的发生率最高，达到了40%（21/53），提示其在MPN发生发展中的潜在重要性。
Panel检测还揭示了4种与MPN个体易感性相关的SNP位点，包括LINC-PINT、THRB-RARB、HBS1L-MYB和GFI1B。这些SNP位点的存在被认为会增加个体罹患MPN的风险，为MPN的遗传学研究提供了新的线索。
图源：摄图网
MPN诊断不仅依赖于临床表现和常规实验室检测，更依赖于基因变异的分析。通过定制化的MPN相关Panel检测，可以一次性筛查多种与MPN发病相关的基因变异，如JAK2、CALR、MPL等经典突变，以及近年来新发现的TET2、EZH2、ASXL1等基因变异，为MPN的精准诊断提供有力支持。
研究表明，RUNX1、NRAS、ASXL1、EZH2、TET2等基因的突变与MPN患者的预后密切相关[3]。通过Panel检测，医生可以及时发现这些预后不良的基因变异，为患者制定更为精准的个体化治疗方案，提高治疗效果和患者生存率。
对于MPN患者而言，复发和耐药是治疗过程中常见的难题。通过定期的Panel检测，可以及时发现患者体内新出现的基因变异，评估其对治疗的敏感性和耐药性，为调整治疗方案提供依据。此外，Panel检测还有助于发现潜在的复发标志物，为早期干预提供可能。
Panel检测作为一种高效、精准的分子诊断技术，在骨髓增殖性肿瘤的分子研究中展现出了巨大的潜力。通过定制化基因Panel，不仅能够全面筛查MPN患者的致病性突变，还能揭示与MPN个体易感性相关的SNP位点。这些发现不仅为MPN的诊断和预后评估提供了有价值的信息，还为MPN的精准治疗奠定了基础。未来，随着技术的不断进步和研究的深入，Panel检测将在更多疾病的临床研究和应用中发挥重要作用。
[1] 张晓密,梁志坤,方鹏,等.泛肿瘤基因突变检测高通量测序基因包的开发及临床验证[J].现代肿瘤医学,2024,32(04):623-628.
[2] 黄秀,邓萱,许笑,等. 基于二代测序的定制化基因panel检测骨髓增殖性肿瘤突变谱[J]. 中华检验医学杂志,2019,42:(6)：427-434.DOI:10.3760/cma.j.issn.1009-8158.2019.06.007
[3] Lundberg P , Karow A , Nienhold R ,et al. Clonal evolution and clinical correlates of somatic mutations in myeloproliferative neoplasms[J]. Blood, 2014,123(14):2220-2228. DOI: 10.1182/blood-2013-11-537167 .
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